进入大殿内，让人目不暇接。正殿依照山势凿成平面，借助山体形成一壁，至今仍然坚固壮观。匠人在山石上凿出海潮大殿的雕刻主体——海潮龙王送女出嫁图。画面左边塑有神态各异的十八罗汉，右边塑有《西游记》人物故事，无不精妙绝伦、逼真入神。
飞来寺的建造及命名，有一个颇具传奇色彩的故事：建寺时选址原定在现址两公里以处的地方，全部用料已经备齐，就在破土动工的头天晚上，柱梁等主要建筑材料不翼而飞，住持和尚派人寻踪追迹。找到现址时，发现柱梁已按规格竖好，且无大殿的后梁后柱，从头以为这是神意，于是遵照神意把寺建于现址，并因柱梁飞来自立，命其为“飞来寺”。今天，站在豆温村边远看飞来寺，确有欲飞之势。山峦叠宕，森林茂密，云雾缭绕之中显现的古寺，有斩云断雾之姿，更有凝而不变之影，真是悬崖陡处辟仙台，琼楼玉宇屹正乙。
